ПЦР-исследования — это метод выявления возбудителя в исследуемом материале по его ДНК. Поскольку ДНК каждого инфекционного агента является уникальной, то анализ точно определяет возбудителя и позволяет диагностировать практически все инфекции. Теоретически для этого достаточно наличия 1 ДНК в материале, поэтому ПЦР-диагностика эффективна и при вяло протекающих инфекциях с малым количеством возбудителя в материале. Для проведения ПЦР-исследования подходят практически любые материалы: отделяемое из половых путей, кровь, мазок из шейки матки, моча, соскоб из мочеиспускательного канала. Результат получают через 1-2 дня. В связи стем, что метод обнаруживает ДНК даже мертвых клеток, течение пары месяцев после пройденного лечения может быть получен ложноположительный результат, поскольку в этот период ДНК мертвых возбудителей могут содержаться в тканях пациента.